Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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