Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms