Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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