Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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