Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms