Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREMQ03060 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms