Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL512310.2-201ENST00000547175 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC02297-201ENST00000548050 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL450344.3-201ENST00000430770 378 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC01548-201ENST00000451980 696 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC090984.1-201ENST00000623172 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms