Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms