Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V0D1P61421 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms