Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP25P60880 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms