Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLA2G16P53816 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLA2G16P53816 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PLA2G16P53816 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLA2G16P53816 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLA2G16P53816 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLA2G16P53816 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLA2G16P53816 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms