Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GSK3BP49841 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms