Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMPHP49418 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMPHP49418 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMPHP49418 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMPHP49418 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPHP49418 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPHP49418 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AMPHP49418 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPHP49418 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPHP49418 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms