Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRATP43155 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRATP43155 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRATP43155 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRATP43155 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRATP43155 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRATP43155 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRATP43155 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRATP43155 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRATP43155 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRATP43155 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRATP43155 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRATP43155 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CRATP43155 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRATP43155 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms