Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PIK3CBP42338 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PIK3CBP42338 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PIK3CBP42338 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PIK3CBP42338 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PIK3CBP42338 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PIK3CBP42338 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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