Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPGP40121 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms