Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms