Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms