Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSSP25774 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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