Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KB1P23443 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KB1P23443 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms