Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms