Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms