Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD8BP10966 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD8BP10966 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD8BP10966 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD8BP10966 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD8BP10966 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD8BP10966 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms