Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCF2P10911 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCF2P10911 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCF2P10911 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms