Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms