Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms