Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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