Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms