Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DXG7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DXG7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms