Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NL46 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NL46 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NL46 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NL46 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NL46 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NL46 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NL46 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NL46 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NL46 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NL46 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NL46 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms