Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms