Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A0A087WSZ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms