Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms