Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPRBQ9Y5M8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms