Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4BQ9Y4P1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms