Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNSTRNQ9Y448 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNSTRNQ9Y448 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms