Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms