Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms