Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms