Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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