Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms