Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-18Q9QC07 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms