Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD1BQ9P298 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms