Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms