Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms