Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms