Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC1Q9NRX5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms