Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms