Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUFT1Q9NNX1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms