Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms